עץ פילוגנטי – Phylogenetic tree הינו שרטוט בצורת עץ המתאר באופן גרפי מתפצל את ההערכות לגבי הקשר האבולוציוני בין מינים בביולוגיה.
שרטוט עץ פילוגנטי נערך בהתבסס על דמיון מורפולוגי או גנטי בין מינים ביולוגיים. זאת מתוך הנחה שקיימות קבוצות טקסון שמייצגת את היצורים החיים שיש להם תכונות משותפות כבעלי אב קדמון משותף MRCA.
